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国外期刊科研数据发表政策分析与比较——以化学类期刊为例

2020-04-15 来源:《情报探索》
  【作 者】李莉、王朝晖:华中师范大学图书馆

  【摘 要】[目的/意义]旨在帮助和促进研究人员顺利发表学术论文。[方法/过程]选取ACS(美国化学学会期刊数据库)、RSC(英国皇家化学学会期刊数据库)和ELSEVIER期刊数据库作为调研对象,对其期刊发表政策中关于科研数据的内容进行整理和分析,深入研究了提交科研数据的类型、格式和方式等。[结果/结论]国外期刊科研数据发表政策已比较成熟,并在不断完善;我国学术期刊界在科研数据管理方面还未形成规模。

  【关键词】科研数据;数据发表政策;期刊论文;学科服务;高校图书馆

  0 引言

  如今,作为已发表研究的基础数据,越来越受到科研人员的重视,被视为可出版、可重复利用和推进新研究的重要资源。越来越多的科研资助机构及学术组织积极支持数据共享,并提出开放数据政策,推行数据管理计划[1]。

  2007年经济合作与发展组织(OECD)发布《OECD公共资助研究数据存取原则和指南》,为政府科学政策和研究资助机构存取公共资助的研究数据提供政策建议,目的是促进研究者、研究机构及组织的数据存取和共享。随后,美国、英国、澳大利亚等发达国家制定了相关法规和政策,启动了各种科学数据共享项目,提出了数据开放政策指南,要求科研人员在申请科研项目时必须提供相应的数据管理计划[2]。美国国家科学基金会(NSF)也对于其所资助的科研项目有强制性的数据出版要求。

  2009年,微软研究院出版的《第四范式:数据密集型科学发现》一书提出了科学研究的“第四范式”——以大数据为基础的数据密集型科学研究。这是继实验型科研、理论推演、计算机仿真3种科研范式后,科研人员进行科学研究及科学发现的主要模式[3-4]。大数据背景下科学研究范式的转变及科研数据剧增,促使期刊制定数据政策。一些期刊出版商将数据的出版作为论文出版的条件,要求科研人员发表论文时,按期刊要求提交科研数据[5]。例如:《科学》杂志规定,投稿的期刊在出版之前,必须将大数据集(包括微阵列数据、蛋白质或DNA序列、大分子结构的原子坐标或电子显微镜图和气候数据)存入已批准的数据库,并在已发表的论文中列入加入号或特定访问地址[6]。2016年9月Nature宣布数据共享政策,投稿作者需要提供“最小数据集”(包含在研究中使用过或产生的公开存档的数据集)的储存地址,让其他人可以解读、重复和进一步发展研究的结果。如果有特殊情况,因隐私权或第三方限制等原因,无法公开数据,必须在数据声明中说明。该政策也鼓励在参考文献中引用数据,如同已发表文献可以引用一般,具有DOI号的数据集也能被引用[7]。

  随着期刊数据政策的制定以及科研数据管理的发展,国内学者对这方面的研究和探索渐渐增加。陈秀娟[2]等以美国化学学会期刊为例,对学科领域期刊科研数据发表政策进行了剖析。吴蓉[5]等从数据提交规范、数据审查、数据存储、数据权益等方面对国外学术期刊教据政策进行了调研与分析。雷秋雨[1]等选取JCR中收录的46种进化生物学核心期刊,对其数据出版政策进行详细调研。黄如花[8]等基于数据生命周期模型,对国外数据期刊政策进行了研究。总的说来,国内的研究大部分是关于科研数据管理,而对期刊数据政策的研究并不多。

  1 ACS、RSC、ELSEVIER期刊数据发表政策

  我们在调研中发现欧美国家实施科研数据管理较早,如今已较成熟。并且,在化学领域ACS(美国化学学会期刊数据库)、RSC(英国皇家化学学会期刊数据库)、ELSEVIER中的期刊极具代表性和权威性。因此,本文选取ACS、RSC、ELSEVIER化学类期刊数据库作为调研对象,对其期刊发表政策中关于科研数据的内容进行整理和分析。

  1.1 ACS期刊数据库发表政策

  美国化学学会(ACS)成立于1876年,现已成为世界上最大的科技协会。多年来,ACS一直致力于为全球化学科研机构、企业、高校及个人提供高品质的文献资源和服务。ACS的期刊内容涵盖24个主要的化学研究领域,被ISI的期刊引用报告(JCR)评为“化学领域最具影响力的期刊”。截至2019年5月,ACS出版期刊62种,每种期刊网站上的“作者指南”里有详细的数据发表政策说明。

  ACS出版期刊62种,其中51种被SCI收录。从期刊发表周期看,月刊最多,共42种;半月刊其次,共11种;周刊最少,共9种。从期刊的数据政策看,有59种期刊有数据要求,要求作者必须提交或者鼓励作者提交科研数据。

  期刊要求作者将数据作为支持信息(Supporting Information,SI)提交。SI文件的类型可以为c3d、cdx、csm、cif、gif、skc、jpg、pdf、qt、tif、zip。

  期刊要求作者利用SI来提供辅助信息,缩短研究文稿的文本。SI必须与稿件同时提交,并单独上传到ACS Paragon Plus。同一类型的所有SI文件都应作为一个文件编写(而不是提交包含单个图像或结构的一系列文件)。要在论文中发表的内容不要上传到SI文件中。根据ACS的政策,SI在发布时立即在互联网上免费公开,而不管附带的论文是否是开放访问的[9]。

  1.2 RSC期刊数据库发表政策

  英国皇家化学学会(RSC)成立于1841年,是以促进全球化学领域研究发展与传播为宗旨的国际权威学术机构。RSC出版的期刊是化学领域的核心期刊,大部分被SCI和MEDLINE收录。截至2019年5月,RSC期刊数据库共出版期刊44种。

  皇家化学学会认为,在可能的情况下,所有与手稿研究相关的数据都应该以可访问和可用的格式免费提供,使其他研究人员能够复制和建立这项研究。RSC的期刊数据发表政策如下:提交稿件时,作者应提供所需的所有数据,以理解和验证论文中所提出的研究。(1)x射线晶体学数据、大分子结构和序列数据应存放在适当的储存库中,并提供完整的数据类型。(2)所有其他需要的数据应作为电子补充资料(ESI)提交。以上是RSC期刊总的数据发表政策,除此之外,有些期刊还有其特定的数据要求。

  皇家化学学会关于附加数据的政策。皇家化学学会认为,在可能的情况下,与手稿研究相关的所有数据都应以可访问和可用的格式自由提供,使其他研究人员能够复制和建立这项研究。因此,除了提交所需的数据,他们鼓励作者尽可能多地存放与论文中的研究有关的数据。这些数据应该存放在适当的、公开可用的存储库中:(1)一个公认的、特定主题的知识库,如针对小分子化学结构和相关数据的ChemSpider或PubChem;(2)机构知识库;(3)总库,如figshare或Dryad[10]。

  电子补充资料(ESI)。作者可以将ESI包含在论文中,以增强和提高研究的影响,包括3D分子模型和电影;作者也可以通过在ESI中放置适当的材料来提高论文的可读性,如重复的实验细节或庞大的数据。作为ESI发布的所有信息是完全归档的,使用CrossMark永久链接在论文中。在准备ESI数据文件时,要注意以下几点:(1)补充数据是经过同行评审的,因此应与原始提交一起列入。(2)以作者提交的ESI文件为准进行发布;编辑人员不会编辑数据的样式或内容。(3)只有当读者能够访问数据时,数据才有用;使用通用的、广为人知的文件格式。(4)大文件可能会增加用户下载和访问的难度。(5)ESI中引用的参考文献应包含在ESI文档中的单独参考文献列表中。

  学会鼓励作者以电子形式提交化合物和光谱的SI。比如化合物,可以提供MOL文件(从化学绘图软件包导出)作为独特的化合物,没有基团或可变的附件;光谱数据,如核磁共振NMR、红外光谱IR、拉曼光谱Raman、电子自旋共振ESR应以jcamp-dx的标准格式提供(jdx文件)。学会提供使复杂分子三维可视化的服务。作者可以使用FirstGlanceinJmoltool?工具准备。

  1.3 ELSEVIER期刊数据发表政策

  Elsevier出版集团是全球最大的科技与医学文献出版发行商之一,提供2500多种同行评议的高品质学术期刊。

  Elsevier期刊鼓励作者共享研究数据,使作者能够在发表的论文中链接数据。研究数据指的是验证研究结果的观察或实验数据。为了便于数据的重复使用,期刊还鼓励作者共享软件、代码、模型、算法、协议、方法以及与项目相关的其他有用材料。

  如果作者在一个数据仓储存储了研究数据,作者可以将论文直接链接到数据集。让读者访问底层数据,使他们更好地理解所描述的研究。Elsevier与多个存储库合作,将ScienceDirect中的论文与相关的知识库链接起来[10]。有不同的方法将数据集链接到论文中。当可用时,作者可以直接通过提交系统中的相关信息将数据集链接到论文。对于支持的数据仓库,存储库标识将自动显示在作者发布在Sci-enceDirect中的论文旁边。此外,作者可以在稿件中以文字链接到相关的数据或实体标识符,使用以下格式:数据库:XXXX(如TAIR:AT1G01020;CCDC:734053;PDB:1XFN)[12]。

  杂志支持Mendeley数据,使作者能够在免费使用的开放存取存储库中存储与手稿相关的任何研究数据(包括原始数据和处理数据、视频、代码、软件、算法、协议和方法)。在提交论文之前,作者可以将相关数据集存储到Mendeley数据中。

  2 ACS、RSC与Elsevier数据发表政策比较

  通过分析ACS、RSC与Elsevier数据发表政策,发现其共同点是他们都制定了详细的数据发表政策;不同点是ACS的每种期刊都列出了详细的数据发表政策,而RSC与Elsevier的数据发表政策是学会制订的总政策,适用于其所有期刊。具体政策比较如表1所示。


表1 ACS、RSC与Elsevier数据发表政策比较
提交要求 ACS RSC ELSEVIER
是否有数据政策
是否必须提交数据 73.6% 的期刊必须提交 必须提交 鼓励提交
数据提交方式 同 一类型的所有支持信息文件都应作为一个文件编写 作为 ESI 发布的所有信息是完全归 档的, 使用 CrossMark 永久链接在论文中 作者可以将数据集直接链接到论文中
数据内容 任何数据(表格、图、光谱、实验程序、边缘点的扩展讨论等) 所有与手稿研究相关的数据 除提交所需的数据外, 作者应尽可能多地存放与论文研究有关的数据
数据存储 以 辅助材料或补充文件形式直接发送给编辑部; 也可存储到指定的数据仓储 x 射线晶体学数据、大分子结构和序列数据存放在适当的储存库中 。 其他数据作为电子补充资料提交 存储到数据仓储中
数据格式 支持信息( SI ) 文件的 类型可以 为 c3d 、cdx 、 csm 、 cif 、 gif 、 skc 、 jpg 、 pdf 、 qt 、 tif 、 zip 使用通用的的文件格式, 光谱数据提供 jdx 文件, 晶体数据提供 cif 格式, 化合物数据提供 MOL 文件 期刊对提交于数据仓储的数据格式没有明确规定
数据审查 由 同行评审的评审员 审查, 数据仓储对所收录的数据进行评议 同行评审对补充数据审查, 数据仓储对所收录的数据进行评议 同行评审对数据初步评估, 数据仓储对所收录的数据进行评议
作者权益 部分期刊根据作者及仓储的要求制 定数据可用的限制 作者可以 选择开放存取出 版或传统途径出 版论文, 研究数据要共享 期刊鼓励和支持作者共享研究数据而非强制

  3 期刊数据发表政策的趋势

  通过以上调查与研究,发现国外期刊数据发表政策有如下趋势:(1)强制性提交数据。作者在提交论文时,必须提交支持该论文或者与论文相关的科学数据。(2)数据提交到数据仓储。许多期刊不堪忍受维护数据的成本和负担,转而要求将数据提交给相应的公共数据仓储和领域数据仓储[13]。合作出版所涉及的数据一般是期刊论文的支持性数据,此种出版模式是由两大数据出版主体机构进行合作,期刊出版商负责接收数据和同行评议,数据仓储负责数据监护和长期保存。二者共同合作,使得科研数据既能保证质量,又能被妥善地长期保存[14]。规范的科研数据引用应如同引用期刊论文一样,可参照一定的数据引用标准,将其纳入论文参考文献之列。(3)提交数据的范围不断扩大。从原始的实验和计算数据开始,到比较完整的与论文研究相关的所有数据(图表数据、派生数据、实验过程数据,分析数据,推导数据、算法等)。

  4 结语

  对期刊科研数据发表政策的分析与研究,可以帮助和促进研究人员顺利发表学术论文,是科研数据管理与服务的内容之一。而科研数据管理与服务属于高校图书馆学科服务之一,是深层次服务。目前,开展这项工作的高校图书馆还不是很普遍。图书馆可以深化学科服务内容,研究各学科的期刊科研数据发表政策,为科研人员提供科研数据管理和存储的相关政策及培训,培训内容可包括数据管理计划、数据存储、数据发表等,阶段性地指导科研人员存储及提交科研数据[15]。

  参考文献

  [1]雷秋雨,马建玲.学术期刊数据出版政策研究综述:以JCR中进化生物学领域期刊为例[J].图书馆理论与实践,2016(1):30-34.

  [2]陈秀娟,吴鸣.学科领域期刊科研数据发表政策剖析:以美国化学学会期刊为例[J].中国科技期刊研究,2015(8):800-807.

  [3]赵斌.第四范式:基于大数据的科学研究[EB/OL].[2015-10-26].http://blog.sciencenet.cn/blog-502444-931155.html.

  [4]丁培.国外大学科研数据管理政策研究[J].图书馆论坛,2014(5):99-106.

  [5]吴蓉,顾立平,刘晶晶.国外学术期刊数据政策的调研与分析[J].图书情报工作,2015(7):99-105.

  [6]Medsci.《Nature》和《Science》杂志投稿要求和说明详解[EB/OL].[2016-09-15].http://www.medsci.cn/article/show_article.do?id=0ad818e6f.

  [7]Kakoli Majumder.Nature新政策要求作者分享数据[EB/OL].[2009-04-03].https://www.editage.cn/insights/1790.html.

  [8]黄如花,李楠.基于数据生命周期模型的国外数据期刊政策研究[J].图书与情报,2017(3):36-42.

  [9]ACS Publications.Information for Authors[EB/OL].[2018-06-19].http://pubs.acs.org/paragonplus/submission/aam-ick/aamick_authguide.pdf.

  [10]Royal society of chemistry.Experimental data policy[EB/OL].[2018-06-19].http://www.rsc.org/journals-books-databases/journal-authors-reviewers/prepare-your-article/exper-imental-data/.

  [11]卫军朝,宋婧婷.学术期刊与科学数据仓储关联研究:兼论图书馆科学文献与科学数据关联的途径[J].图书与情报,2018(1):126-133.

  [12]Elsevier.Guide for Authors[EB/OL].[2018-06-19].https://www.elsevier.com/journals/analytica-chimica-acta/0003-2670/guide-for-authors#87500.

  [13]陈全平.学术期刊数据政策及相关研究[J].图书与情报,2015(5):9-15.

  [14]张静蓓,任树怀.科研数据出版模式、流程及引用策略研究[J].图书情报工作,2015(9):21-27.

  [15]陈秀娟,吴鸣.学科领域科研数据知识库调研与分析:以化学领域为例[J].图书情报工作,2015(9):111-118.

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